Counterstrike Source unterstützt meines Wissens keine X2, so gesehen ist es nicht verwunderlich, dass nur eine GPU angesprochen wird. Bei Crysis könnte das Problem eventuell an einem nicht-gepatchten Spiel liegen.
Da offensichtlich sonst alles passt, sprich 3D Mark Werte in Ordnung sind usw., würde ich zumindest bei diesem Problem mal auf das Spiel tippen.
Dass sich die GPUs nicht runtertakten im 2D-Betrieb, hängt möglicherweise mit einem fehlerhaften oder nicht aktivierten Powermanagement im Treiber zusammen. Dagegen sollte dann ein neuer Treiber helfen, soweit AMD einen Fix zu diesem Problem bereits integriert hat.
Seit ca. 20 Minuten gibt es die Catalyst 9.4 Treiber-Suite. Eventuell solltest du es damit mal probieren
http://game.amd.com/us-en/drivers_catalyst.aspx -> einfach Treiber für dein OS auswählen und runterladen.