hm, schwer zu sagen. die LED am Mainboard leuchtet einfach, wenn 5V Standby anliegen, solange die LED selbst nicht defekt ist leuchtet die eigentlich immer, wenn das Netzteil die 5VSB bringt, also ist das nicht sehr aussagekräftig.
Interessant das die LEDs der Grafikkarten leuchten. Leuchten die erst, wenn du versuchst einzuschalten (sollten sie eigentlich, die leuchten, denke ich, erst wenn 12V anliegen)? Das würde ja dann heissen, dass das Mainboard nicht ganz tot sein kann, es merkt immerhin, dass es eigentlich einschalten müsste und startet das Netzteil.
Trotzdem würde ich mal auf das Board tippen. Habe vorhin das Handbuch runtergeladen. Hab darin allerdings keine Angabe gefunden, wann es piepsen würde. Normalerweise tun die das aber schon, abhängig vom installierten BIOS. Und der interne Lautsprecher muss natürlich angeschlossen sein, sonst kanns nicht piepsen

Hattest du die CPU übertaktet?
Hast du eine Wasserkühlung?